| １Ｆ | 補給所：なし | 宝箱：アメジスト・パンジーの種×２ |
マップから入ってすぐの建物外に宝箱とパンジーの種があります。攻略ルートによってはここでパンジーの種が合計１０個を越えますので、その際は中に入る前に一旦ウェルカムハウスに戻って、花穂に種を渡してください（１０個目を植えると花穂が「小さなパンジー」を覚えます）。なお、可憐・花穂ともに奇跡の指輪LV2を装備できますが、小さなパンジーを覚えた後は、花穂に持たせておくべきでしょう。パーティの生存性が格段に向上します。
建物内では、行ける順番に進んでいけばいいです。５ヶ所ある鉄格子で、最初にどれが進めるのかは、見てわかるかと。
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| 管理室 | 補給所：なし | 宝箱：なし |
| マップ内に点在している日記の切れ端を読んでいけば、この施設が放棄された概要がおぼろげに見えてきます。さしあたって次のエリアに進むヒントとなるのは、階段降りてすぐ隣りにある部屋の日記です。「寝室で鍵を紛失」…まぁ、いかにもなところに落ちている訳ですが。 |
| レベル"D"実験場 | 補給所：なし | 宝箱：転移石・ハイアンク・ヒールストーン・女子制服（戦闘用） |
まずは、階段降りて左への通路を突き当たりまで行って上へ、そのまま道なりに奥まで行って下さい。いきなり鍵が落ちています。
もちろん、鍵へのルート以外の場所には宝箱やらあるのですが、鍵を入手したら、他は無視してまずは１Ｆに戻ってレベルＣへ向かって下さい。レベルＣに降りた目の前にセーブポイントがありますので、そこで回復してから改めてレベルＤの攻略を行った方がよいかと。
ここの敵は数が多く、結構手のかかる敵も多いのですが、蘇生玉（リザード）・ピックル帽子（ピックル）・SPブースト（マンイーター）とそれなりの物を落とすので、レベルＣへの補給路が開けたら、ここでしばらく頑張ってみるのもいいかも。
ところで、ここに出て来るトレントは、これまでのフィールドとかに出て来るトレントとは強さが若干違うのですが（具体的にはＨＰが200ぐらいあったり突然変異（メルポイズンへ変化）がある。攻撃や防御の面ではそんなに変化を感じないけど、パーティの強化と相殺されてるのかも）、リストの中では他のトレントと同一に扱っています。 |
| レベル"C"実験場 | 補給所：１（セーブ１） | 宝箱：ルビー・サファイア・トパーズ・エメラルド・ルナストーン・アメジスト |
１Ｆから降りてきてすぐにセーブポイントがあり、このエリアの敵は１匹毎に独立してるようなものなので、１戦闘毎に補給に戻れば攻略は難しく無いかと。ここで出て来る敵は四つ足の鳥を除いて単体出現で、他のマップに出てきたボスキャラが出てきます（ボスキャラとして出てきた物とは微妙に能力が違います）。もし、ルビーアイやフェンリルの写真を入手してなかった場合は、ここでフォローできます。また、クレイドンの写真も手に入りますので、一度は航をここへ連れてくる必要があります。
上部エリアの四つ足の鳥の先のレバーを降ろすと、下部エリアから先へ進めるようになります。 |
| 非常用通路 | 補給所：なし | 宝箱：なし |
初回訪問時はここへ入ったとたんにイベント発生で亀裂の主との戦闘になります。戦闘は10ターン経過で強制終了となりますので、戦わずに全員「身構える」＆回復でやり過ごした方がいいでしょう。
２度目以降は落石のため通り抜け不能になっています。 |
| 魔具合成炉 | 補給所：１（セーブ１） | 宝箱：なし |
初回訪問時はイベント発生で可憐・花穂の武器強化になります。この時、パーティ所有の鋼鉄は消費しません（恐らく藍子が鋼鉄を所持しているのだと。このため、もしここまで１つも鋼鉄を取らずにやってきたとしても、このイベントは発生すると思われます）。
このイベントが終了すると、マップクリアとなって自動的に生体研究所の外へ出ます。その時点で、生体研究所のキャラ制限が無くなり、誰でも入れる様になります。また、１Ｆから魔具合成炉へ直接出入り出来るようになります。
魔具合成炉では「鋼鉄」「白銀」を使用する事により、各キャラの固有武器の強化ができます（※「白銀」はver2では入手不可です）。ver2では「鋼鉄」は宝箱からの入手では全員分揃いません（Drop品で鋼鉄を落とす敵はいるので、頑張れば全員分揃える事は可能）。ver2での総勢９名中、２名はイベント強制ですので、残り７名。このうち誰の武器を強化するかは自由なのですが、鞠絵の武器は必ず強化して下さい（迷宮図書館B1Fへの進入条件です）もちろん、最初にここに来た時点では鞠絵は未加入なので、鞠絵の分の鋼鉄を１つ残しておく、ということです。
なお、強化する対象キャラは、既にメンバーに加入していれば選択可能で（ちかげは離脱してるので不可。もっとも、生体研究所クリア後の時点ではパーティアイテムにも闇の十字架はありませんので、どのみち強化のしようもありませんが。）、パーティメンバーとしてその場にいる必要はありません。 |
| 名前 | EXP | お金 | Drop | 出現場所 | 技能 | 備考 |
| ゾンビ | 25 | 10 | 毒消し草 | 生体研究所 管理室 | 腐食攻撃：P単体D(防御↓) | 特効：聖 |
| コープス | 33 | 12 | 治療薬 | 生体研究所 管理室
生体研究所 レベルＤ | 腐食攻撃：P単体D(防御↓)
生気吸収：P単体D吸 | 特効：聖 |
| ノイズ | 15 | 15 | ポーション | 生体研究所 管理室
生体研究所 レベルＤ | 逃走
吸い付く：P単体D吸
パニックノイズ：P全体D(暴走) | 特効：飛行 |
| マンイーター | 32 | 60 | SPブースト | 生体研究所 レベルＤ | 触手撃：P単体D
ラ・ピア：E全体回復
花粉：P全体(盲目) | |
| トレント | 10 | 2 | ポーション | 生体研究所 レベルＤ | 触手撃：P単体D
ピア：E単体HP回復
突然変異：メルポイズンへ変化 | |
| メルポイズン | 40 | 33 | 治療薬 | 生体研究所 レベルＤ | 骨砕き：P単体D（打撃↓）
スタンハンド：P単体D(攻撃↓・麻痺) | |
| リザード | 41 | 32 | 蘇生玉 | 生体研究所 レベルＤ | 体当たり：P単体D（転倒）
暴れまくり：P全体D | |
| ピックル | 20 | 36 | ピックル帽子 | 生体研究所 レベルＤ | しがみつき：
忍耐：E自身(防御↑・剣↑・槍↑・打撃↑) | |
| ペットデーモン | 25 | 50 | アンク | 生体研究所 レベルＤ | ワードオブナイトメア：P単体D(攻撃↓・睡眠)
エフパ：P全体（沈黙)
悪魔の咆哮：P単体D(魔法↓・封印) | |
| Level_D 四つ足の鳥 | 150 | 150 | ヒールストーン | 生体研究所 レベルＣ | バズナグ：P単体D
ス・トラク：E自身(敏捷↑)
ス・ラスト：P単体D(敏捷↓)
ア・トラク：E自身HP回復(攻撃↑)
ア・ラスト：P単体D(攻撃↓)
クチバシ撃：P単体D(封印) | 固定
復活無し |
Level_C 赤い目
（写真入手可） | 150 | 200 | 獄炎符 | 生体研究所 レベルＣ | ルビーアイ：P単体D吸
火炎のブレス：P全員D
バズナグ：P単体D
火精吸収：E自身SP回復
| 写真は「ルビーアイ」
火炎のブレス→火精吸収の間、ターン開始時にP全員8D |
Level_C 氷の狼
（写真入手可） | 140 | 222 | 銀氷符 | 生体研究所 レベルＣ | スラッシュファング：P単体D
ブリザード：P全体D(魔法力↓)
ヒュラ：P単体D
ヒュレイ：P全体D
氷精吸収：E自身SP回復 | 写真は「フェンリル」
ブリザード→氷精吸収の間、ターン開始時にE全体HP回復30 |
Level_C 泥の塊
（写真入手可） | 162 | 50 | 轟雷符 | 生体研究所 レベルＣ | 凶暴化：E自身(攻撃↑・防御↑・敏捷↑)
バイオハザード：P全体D(毒)
放電：P全体D
ライ：P単体D | 写真は「クレイドン」 |
| Level_C 一つ目巨人 | 145 | 145 | ハイアンク | 生体研究所 レベルＣ | ギガンフィスト：P単体D
ギガンバースト：P全員D
ダ・トラク：E自身HP回復（防御↑）
| |
| Level_C 狂獣 | 100 | 120 | ヒールストーン | 生体研究所 レベルＣ | ギガンフィスト：P単体D
バズナグ：P単体D
突き抜ける衝撃：痛恨 | |
| Level_B 亀裂の主 | -- | -- | | 生体研究所 非常用通路 | 警戒：
グラヴィトン：P全体D
ヘヴィテイル：P単体D(転倒) | 10ターン経過で逃走
→戦闘終了 |